网站首页技术中心 > 利用WIWAM XY植物表型成像系统鉴别新型罗替血红蛋白类似物
产品中心

Product center

利用WIWAM XY植物表型成像系统鉴别新型罗替血红蛋白类似物

发布时间:2022-05-11 点击量:94

疥链霉菌是一种与常见疥痂相关的植物病原菌。这主要归因于它能够产生植物毒素thaxtomin A,其生物合成由纤维二糖触发。在对纤维二糖存在时释放的其他代谢物的调查中,我们在含有疥链霉菌的thaxtomin提取物中发现了其他化合物。质谱(MS)和核磁共振(NMR)结构分析表明,这些化合物是TOR(雷帕霉素靶点)激酶(TORK)途径抑制性脂肽rotihibin A的氨基酸序列变体,主要化合物命名为rotihibin C和D。与thaxtomin相反,在葡萄糖存在的情况下也能诱导产生Rotihibin C和D,这表明它们的生物合成受到不同的调节。通过shotgun法和靶向蛋白质组学的结合,S. scabies 87-22. 簇跨越33 kbp,编码2种不同的非核糖体肽合成酶(NRPSs)和12种附加酶。在其他公开获得的完整放线菌基因组中发现了同源rth生物合成基因簇。Rotihibins C和D在低浓度下对小柠檬和拟南芥具有除草活性,这可以通过监测对生长的影响和光系统II的最大光化学效率来证明。Rotihibins A和B是作用于TORK途径的植物生长抑制剂。研究报告了从疥链霉菌中分离和鉴定新的罗地血红蛋白序列类似物,这是马铃薯和其他块茎和根类蔬菜中常见疥痂的主要原因。通过结合蛋白质组学数据和基因组分析,发现了一个神秘的生物合成基因簇,编码能够产生罗替血红蛋白的酶机制。这项工作协助实现通过生物技术生产该脂肽变体,以研究其在拟南芥中靶向植物TORK途径的确切机制。此外,生物信息学揭示了与植物相关的链霉菌菌株中存在其他变体,包括致病性和非致病性菌株,这提出了关于这种脂肽实际功能的新问题。在非核糖体肽合成酶(NRPS)中发现一个模块,该模块包含异常瓜氨酸残基,这可能改进对由隐蔽的NRPS基因簇编码的肽的预测。

image.png

image.png

QQ在线客服
电话咨询
  • 010-82794912